• Проблемы гена. Экспериментальные и теоретические исследования по генетике популяций (основы хромосомной инженерии);
  • Эффект положения гена. Целенаправленное изменение хромосомного комплекса создание кариотипических рас;
  • Методы радиационной селекции; 
  • Космическая генетика;
  • Методы полиплоидии;
  • Радиационная генетика;
  • Генные мутации;
  • Антимутагенез;
  • Механизм образования структурных мутаций хромосом;
  • Орнитология и полезащитное лесоразведение;
  • Значение новых фундаментальных достижений биохимической генетики, генетической инженерии для теории и практики селекции;
  • Генетически управляемый апомиксис и его значение в селекции растений;
  • Геногеография кур;
  • Философские проблемы генетики ;
  • Частная генетика кролика;
  • Биологическое и социальное в проблеме человека;
  • Проблема происхождения жизни на Земле;
  • Проблемы цитогенетики;
  • Проблема нестабильности генома и теория потенциальных изменений;
  • Мутагены среды и наследственность человека – заложены основы экологической генетики;
  • Проблемы шелководства. Частная генетика тутового шелкопряда;
  • История генетики.

Популяционные и эволюционные исследования Н.П. Дубинина:

  • Эволюция кариотипа (Эволюция популяционной структуры);
  • Эволюция генных копий;
  • Динамика хромосомных перестроек;
  • Летальные гены и приспособленность популяций;
  • Генетико-автоматические процессы (экотипы);
  • Интеграция сложных признаков;
  • Социальная (культурная) наследственность.